Да, при каждом запуске приложение проверяет наличие обновлений на сервере, скачивает их и устанавливает автоматически. Полная переустановка / обновление из инсталлятора требуется только в случае, если файлы программы были повреждены. По этой же причине мы НЕ рекомендуем изменять папку установки - "Program Files" обычно защищена от записи (с последних версиях Windows на типовых настройках), а AppData, в которую приложение по умолчанию устанавливается не имеет такой защиты, а значит не возникнет проблем при обновлении.